Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPE65Q16518 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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RPE65Q16518 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPE65Q16518 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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