Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NTRK3Q16288 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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