Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP6AP1Q15904 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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