Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CEBPEQ15744 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CEBPEQ15744 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms