Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ALX1Q15699 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ALX1Q15699 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ALX1Q15699 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ALX1Q15699 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ALX1Q15699 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
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