Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SHBQ15464 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHBQ15464 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHBQ15464 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SHBQ15464 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SHBQ15464 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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