Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PUM3Q15397 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PUM3Q15397 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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