Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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