Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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PTPAQ15257 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTPAQ15257 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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