Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PRKD1Q15139 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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