Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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BRD3Q15059 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BRD3Q15059 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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