Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERPUD1Q15011 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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