Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NFIXQ14938 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
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