Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SEMA3AQ14563 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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