Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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