Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNA1SQ13698 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
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