Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
BFSP2Q13515 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
BFSP2Q13515 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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