Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LSAMPQ13449 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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