Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CLN3Q13286 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLN3Q13286 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLN3Q13286 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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CLN3Q13286 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CLN3Q13286 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
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