Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
GRIN2BQ13224 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIN2BQ13224 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
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