Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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