Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
DUSP4Q13115 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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