Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPN13Q12923 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPN13Q12923 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPN13Q12923 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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PTPN13Q12923 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PTPN13Q12923 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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