Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFCP2Q12800 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms