Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SREBF2Q12772 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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