Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CCDC173Q0VFZ6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC173Q0VFZ6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms