Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RASGEF1BQ0VAM2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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