Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMOD3Q0VAK6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms