Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACSM1Q08AH1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms