Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSRP1Q08945 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms