Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms