Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL16A1Q07092 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL16A1Q07092 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms