Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHRNDQ07001 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms