Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE3AQ05086 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE3AQ05086 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms