Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DSG1Q02413 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms