Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PLCB3Q01970 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PLCB3Q01970 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms