Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms