Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUD4Q01804 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
OTUD4Q01804 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms