Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms