Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms