Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXC5Q00444 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms