Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms