Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ASIC1P78348 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ASIC1P78348 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms