Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
DCDC1P59894 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCDC1P59894 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms