Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RIPK4P57078 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms