Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRPF1P55201 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms