Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms