Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARFIP2P53365 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARFIP2P53365 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms