Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NKX2-5P52952 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms