Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EFNA4P52798 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms